在服务器上运行安装R包程序。示例代码如下：shebang line，指定Rscript解释器路径。安装BiocManager，用于安装生物信息学包。安装SpatialExperiment包。install.packages("spdep") #单独安装spdep包。BiocManager::install("SpatialExperiment")遇到报错："there is no package called ' '”，解决办法是单独安装...
R包安装常见报错 另一个常见问题是镜像设置。清华大学的bioconductor镜像在更新后，旧版本数据可能引发报错。此时，更换镜像源，如西湖大学，是解决方案之一。不过，install.packages()函数仍可使用清华镜像安装CRAN的包。有时，R包来源的不确定性也会导致安装报错。R包通常来自CRAN、Bioconductor或Github，所以安装前务必确认来...
[ERROR] R包安装的 non-zero exit 可以尝试重新安装tk和tcl。清理R环境：在极端情况下，可能需要完全卸载R并删除所有相关文件，然后重新安装R和所需的包。使用BiocManager：对于Bioconductor上的包，建议使用BiocManager进行安装，因为它可以自动处理版本依赖和兼容性问题。总之，解决R包安装中的“non-zero exit status”错误需要仔细分析错误信息...
R包安装报错之Rtools及权限问题! 检查并修改安装路径：如果仍然遇到权限问题，可以尝试将R或R包的安装路径更改为一个不需要管理员权限即可写入的目录。例如，可以将R安装在用户目录下，而不是默认的Program Files目录下。清理临时文件：有时候，临时文件可能会占用某些路径，导致无法写入。可以尝试清理R的临时文件目录，通常位于用户目录下的T...
R包安装错误解决记录 原因：镜像设置错误。解决方法：修改RStudio镜像地址，使用合适的Bioconductor镜像源。HPO.db和MPO.db包安装失败：解决方法：对于Windows系统，可以尝试下载数据库文件至本地后手动安装。原因：R锁定文件夹未正确释放。备注：此情况需要查找具体的解决方法来释放锁定的文件夹。MetaboAnalystR包、RMassBank包安装...
